More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1604 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  44.49 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  43.27 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  39.16 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  43.66 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  43.87 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  37.97 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  43.28 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  43.28 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  41.11 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  42.91 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  43.28 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  37.96 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  42.54 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  37.59 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  42.16 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  40.73 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  39.07 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  38.02 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  38.95 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  40.21 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  37.91 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  37.09 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  40.66 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  34.44 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  36.68 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  37.59 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  38.85 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  37.77 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  35.96 
 
 		 292 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  34.49 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.49 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  31.97 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  40.8 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  29.74 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  32.18 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  32.18 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.34 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.66 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.61 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.76 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.7 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.25 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  28.63 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  29.22 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.87 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  29.69 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>