159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2238 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  100 
 
 		 261 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  53.03 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  51.71 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  51.71 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  51.49 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  54.51 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  53.73 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  52.55 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  52.55 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  52.94 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  52.55 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  53.73 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  52.16 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  48.68 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  47.84 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  41.13 
 
 		 266 aa  218  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  41.04 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  38.15 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  38.24 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  38.95 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  36.57 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  36.93 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  31.85 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  34.94 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  34.57 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  32.03 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  36.33 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  33.81 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  30.8 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  31.16 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  32.22 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  31.27 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  28.47 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  32.22 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  41.46 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  26.98 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.98 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  26.52 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  27.85 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.57 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  26.32 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.1 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.1 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  26.32 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.52 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.52 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  27.39 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.32 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  31.3 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  31.3 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.84 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.6 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.14 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.14 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.14 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  32.76 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.69 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  25.76 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  25.76 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  31.9 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.21 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  23.59 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  33.03 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  31.03 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  31.03 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.95 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.56 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  23.27 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  26 
 
 		 541 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>