More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7163 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  42.01 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  44.91 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  44.24 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  41.91 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  41.91 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  41.91 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  44.01 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  40.44 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  37.27 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  38.02 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  39.86 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  31.97 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  34.32 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  34.18 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  32.49 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  33.21 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  38.16 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  38.91 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  29.43 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  35.15 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  34.67 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  32.07 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  32.07 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  34.36 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  25.78 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  44.72 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.62 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.1 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.1 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.1 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  27.88 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.25 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.91 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.64 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.98 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  28 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  29.95 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  28 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.64 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.5 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  34.34 
 
 		 159 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.1 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.48 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.12 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.78 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.39 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.81 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.66 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.09 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>