More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4949 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  69.2 
 
 		 266 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  38.89 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.83 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  36.65 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.16 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.25 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  36.55 
 
 		 316 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  35.91 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.8 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.79 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.38 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.18 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  34.13 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  39.13 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  25.61 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.64 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.68 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.64 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.62 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.74 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.74 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  40 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.74 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.74 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  28.33 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.52 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  34.51 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.65 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.84 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.43 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.25 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.65 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.42 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.65 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.63 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.94 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.71 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.65 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  32 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>