More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  97.76 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  66.93 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  62.93 
 
 		 263 aa  328  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  54.02 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  41.38 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  41.38 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  41.38 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  41.76 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  41.38 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  41.38 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  32.82 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.38 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.62 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  31.38 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  29.7 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  29.74 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  22.58 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.37 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.15 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  28 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  38.38 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.75 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  29.61 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  48.21 
 
 		 127 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  26.36 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1875  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1729  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0885  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0374  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0280  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.13 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.27 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.13 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.61 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.25 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.55 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  27.22 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.63 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  27.22 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.53 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.14 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  28.98 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.88 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  25.79 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>