133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2634 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  98.89 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  43.68 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  41.83 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  43.89 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  42.75 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  43.68 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  43.68 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  42.01 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  43.3 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  43.68 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  42.91 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  42.53 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  26.72 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  25.09 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  29.5 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  28.37 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  27.9 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  32.18 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  23.91 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  28 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  28 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  27.19 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  25.87 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  25.87 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  24.18 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  30.38 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  30.57 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.23 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  25.85 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  23.77 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.71 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  22.39 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.06 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  24.56 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  24.56 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.76 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  23.79 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  35.16 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  26.4 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  34.52 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.12 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  21.39 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  23.6 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  29.71 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  26.54 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2374  precorrin-8W decarboxylase, putative  33.66 
 
 		 187 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0182458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>