253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1452 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  36.11 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  36.11 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  35.56 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  35.56 
 
 
260 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  37.57 
 
 
262 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
263 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  32.19 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  34.22 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  31.87 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.19 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.44 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  26.92 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.62 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  26.52 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.49 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  32.52 
 
 
246 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  27.94 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  27.94 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  21.86 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  22.46 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  24.79 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  35.45 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  27.13 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.84 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  28.03 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  24.37 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  23.48 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.71 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  22.73 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  28.03 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35 
 
 
310 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.21 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.29 
 
 
251 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  24.37 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  24.28 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  24.37 
 
 
272 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.37 
 
 
253 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  24.37 
 
 
272 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 
238 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  23.3 
 
 
237 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  23.11 
 
 
272 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  24.37 
 
 
272 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  23.74 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.02 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  22.65 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.45 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  22.96 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
581 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  32.67 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
204 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.68 
 
 
377 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.93 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  22.57 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.85 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.51 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  22.69 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  29.3 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>