More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04785 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
266 aa  553  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  49.23 
 
 
255 aa  271  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  48.85 
 
 
255 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  48.85 
 
 
255 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  48.85 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  48.08 
 
 
255 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  48.53 
 
 
267 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  47.69 
 
 
255 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  48.08 
 
 
255 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  47.69 
 
 
255 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  48.5 
 
 
264 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  49.06 
 
 
263 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  47.69 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  45.52 
 
 
264 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  44.65 
 
 
267 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  46.42 
 
 
269 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  45.42 
 
 
257 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  41.13 
 
 
261 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  39.18 
 
 
268 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  36.57 
 
 
283 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 
276 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  37.97 
 
 
276 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  35.27 
 
 
292 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  39.93 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
285 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  33.21 
 
 
273 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  33.7 
 
 
280 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  38.99 
 
 
285 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  38.99 
 
 
285 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  32.84 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  32.46 
 
 
273 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  36.76 
 
 
277 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  31.97 
 
 
271 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  31.65 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  34.21 
 
 
272 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  33.81 
 
 
283 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.1 
 
 
283 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  32.86 
 
 
281 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
279 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  34.94 
 
 
283 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  34.17 
 
 
309 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  36.24 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  30.45 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  25.82 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  44.19 
 
 
159 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  26.47 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 
262 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  29.96 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  29.74 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  30.17 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  29.37 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
286 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  29 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  30 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.15 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.31 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.55 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  26.41 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  25.38 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.64 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  27.99 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  27.99 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  25 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.79 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  27.75 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.79 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.79 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.65 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.79 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  24 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.79 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  25 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  28 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.66 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.48 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.14 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  24.63 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.53 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.89 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>