221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0459 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  62.89 
 
 
262 aa  331  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  62.93 
 
 
269 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  62.55 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  45.1 
 
 
260 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  45.1 
 
 
260 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  48.69 
 
 
283 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  44.19 
 
 
260 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  44.71 
 
 
260 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  44.71 
 
 
260 aa  225  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  44.31 
 
 
260 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  43.63 
 
 
258 aa  221  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  43.53 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  45.7 
 
 
260 aa  211  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  36.4 
 
 
251 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 
258 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 
254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
272 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  30.39 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  29.44 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  29.44 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  29.82 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  29.95 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  29.49 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  26.2 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.02 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  37.19 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  26.63 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.63 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  22.27 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
362 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.84 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  25.87 
 
 
278 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  46.77 
 
 
127 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  31.02 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  25.53 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.64 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.13 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.04 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  35.2 
 
 
465 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  35.2 
 
 
465 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  23.47 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.4 
 
 
453 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.17 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.58 
 
 
456 aa  54.7  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  25.67 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  25.67 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  28.84 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
299 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  25.84 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
275 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
275 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.42 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.12 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.63 
 
 
443 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.09 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
286 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
236 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
457 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  25.63 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  36.05 
 
 
410 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  36.11 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.58 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>