20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0330 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  269  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  63.08 
 
 
251 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  48.72 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  45.07 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  47.76 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  47.76 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  47.76 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  46.27 
 
 
260 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  52.73 
 
 
260 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  45.07 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 
258 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  44.78 
 
 
260 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  44.78 
 
 
260 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  43.28 
 
 
260 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  46.77 
 
 
263 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2506  methyltransferase  42.37 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.860173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 
283 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  50 
 
 
269 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  48.21 
 
 
269 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  47.37 
 
 
262 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>