More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2171 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  91.73 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  70.16 
 
 		 258 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  43.39 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  42.98 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  42.98 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  42.98 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  42.56 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  42.56 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  41.74 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  32.82 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  32.82 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  28.02 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  25.61 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  45.07 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  22.04 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.17 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.21 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.3 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.83 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  24.86 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.37 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.36 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.07 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  34.62 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.86 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.03 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.46 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.33 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.46 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.46 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  22.78 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.3 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.38 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.83 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  29.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.23 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 304 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.83 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.04 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.51 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  27.43 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.53 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  24.58 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.78 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  23.47 
 
 		 663 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>