214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4070 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  66.93 
 
 
269 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  66.93 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0459  Methyltransferase type 11  62.89 
 
 
263 aa  331  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.724733  normal  0.90808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  51.74 
 
 
283 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  43.08 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  41.92 
 
 
260 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  41.92 
 
 
260 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2801  Methyltransferase type 11  43.58 
 
 
258 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  42.69 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  41.92 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  41.54 
 
 
260 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  41.92 
 
 
260 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  45.95 
 
 
260 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0116  Methyltransferase type 11  38.22 
 
 
251 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
254 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1783  Methyltransferase type 11  35 
 
 
258 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  35.8 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
272 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.24 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  35.14 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.59 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.9 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  40 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2506  methyltransferase  40.91 
 
 
71 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.860173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
316 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  35 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  30.11 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  30.37 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  30.11 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0330  hypothetical protein  47.37 
 
 
127 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.43 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.04 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  38.89 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  29.82 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  29.82 
 
 
272 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  29.82 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.95 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.94 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  19.58 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  23.76 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  50 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.81 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.87 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  28.69 
 
 
377 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.95 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  28.95 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.71 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.95 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 
271 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.2 
 
 
239 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.76 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.13 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  29.41 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  28.57 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.71 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.19 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.87 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.62 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  31.93 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  28.22 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
675 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
305 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  25.82 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
281 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
280 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>