222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1908 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  99.27 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  95.24 
 
 		 273 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  51.74 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  46.44 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  45.02 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  41.91 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 269 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  40.82 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  36.43 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  37.96 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  40.5 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  32.84 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  39.03 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  38.66 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  37.92 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  37.13 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  33.81 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  37.13 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  37.13 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  37.55 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  36.92 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  34.07 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  37.09 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  34.94 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  34.41 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  32.96 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  31.6 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  32.85 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  31.49 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  32.29 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.2 
 
 		 248 aa  95.9  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  35.83 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  26.61 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.47 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  28.77 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.53 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  28.12 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  29.69 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  35.43 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.12 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.24 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.44 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1452  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.78 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4070  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  0.0929931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  26.76 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.07 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2167  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.632229  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  23.28 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  27.57 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  27.57 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.13 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.96 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>