More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5884 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  100 
 
 		 264 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  43.19 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  41.04 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  32.44 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  31.14 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  26.18 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.52 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  29.33 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  29.63 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  30.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  30.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  30.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  30.95 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.87 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 242 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  29.6 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  29.6 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  29.6 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  29.6 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  29.6 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  29.6 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.04 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  29.15 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.86 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.58 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30.53 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30.53 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  31.44 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  23.92 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  25.22 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  25.22 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.53 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  30.73 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.67 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  25.79 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  23.14 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  24.89 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.14 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  25.88 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.63 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  24.78 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.81 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.53 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  23.35 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>