More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4343 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  99.59 
 
 
246 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  97.56 
 
 
246 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  89.43 
 
 
243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  83.4 
 
 
243 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  45.73 
 
 
239 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  41.08 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  47.89 
 
 
244 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  42.61 
 
 
259 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
250 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  37.55 
 
 
237 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40.41 
 
 
266 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.32 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
257 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.47 
 
 
236 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.77 
 
 
235 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.9 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.05 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 
238 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.05 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.92 
 
 
236 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.03 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.64 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  32.08 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  29.92 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  29.92 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  29.92 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  29.92 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.35 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  38.62 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  50.49 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  36.06 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  29.55 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  28.83 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  40.27 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.98 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.43 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.47 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  41.75 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.88 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.88 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.63 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.8 
 
 
319 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  38.34 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.93 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.44 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.07 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  33.86 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  35 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  29.38 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.12 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  43.14 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  43.14 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  44.12 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  43.14 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  42.42 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.53 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.9 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  39.09 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25.12 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  25.12 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  43.14 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>