277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  98.59 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  65.6 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  65.25 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  65.25 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  65.25 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  61.84 
 
 		 292 aa  348  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  54.09 
 
 		 281 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  51.44 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  48.43 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  68.46 
 
 		 159 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  33.1 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  36.3 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  37.91 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  36.4 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  36.56 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  35.69 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  35.17 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  31.27 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  35 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  33.79 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  35.25 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  31.12 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.07 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  32.23 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  32.16 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  30.53 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  30.38 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  29.88 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.34 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  26.51 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  26.51 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.07 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  25.87 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.31 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  26.51 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  28.77 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  26.1 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  26.19 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  25.79 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  26.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  28.28 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  24.5 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  25.13 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.02 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.5 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.53 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.63 
 
 		 541 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.92 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.74 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.14 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>