More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6010 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  97.15 
 
 
246 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  97.56 
 
 
246 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  89.67 
 
 
243 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  83.82 
 
 
243 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  45.73 
 
 
239 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  41.08 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  47.89 
 
 
244 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  43.04 
 
 
259 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  41.74 
 
 
266 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
250 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  37.13 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
260 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.47 
 
 
235 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
257 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.05 
 
 
236 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.9 
 
 
234 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.93 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.2 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.78 
 
 
238 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.67 
 
 
233 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.42 
 
 
236 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
231 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  51.46 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.11 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  26.94 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  38.1 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  28.38 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  36.56 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  30.35 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  28.79 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  28.79 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  28.79 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  29.55 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  28.79 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
219 aa  72  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  40.78 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  44.17 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  32.32 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  40 
 
 
362 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  32.83 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.12 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.93 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  42.16 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  42.16 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.53 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.97 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  42.16 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  28.87 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.35 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  38.46 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  37.1 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.69 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  34 
 
 
276 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  39.67 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
223 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  38.18 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  38.18 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  42.16 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.46 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>