246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4368 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  74.05 
 
 		 264 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  62.26 
 
 		 267 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  60.23 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  59.85 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  59.85 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  59.85 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  59.47 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  59.85 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  60.61 
 
 		 255 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  59.85 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  60.46 
 
 		 255 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  55.26 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  51.7 
 
 		 257 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  51.71 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  48.7 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  45.52 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  44.04 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  40.96 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  39.93 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  37.91 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  33.45 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  32 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  32.49 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  32.48 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  36.62 
 
 		 285 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  33.21 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  35.27 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  33.45 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  33.91 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.22 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  34.84 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  31.03 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  30.24 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  44.44 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  32.47 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  27.76 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  27.19 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  28.52 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.76 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  26.75 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.76 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.38 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  27.38 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  27.38 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  30.28 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3179  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0194529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  29.36 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  29.36 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  28.44 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.85 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.85 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.61 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.44 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.44 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  28.44 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  38.18 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.82 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.37 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  35.19 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  34.26 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  34.26 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 229 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.11 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  26.32 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>