More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1409 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  62.7 
 
 
246 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  63.52 
 
 
246 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  63.11 
 
 
244 aa  307  8e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  47.11 
 
 
260 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  50.62 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  48.35 
 
 
269 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 
269 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  46.5 
 
 
244 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  45.08 
 
 
245 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  44.81 
 
 
262 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  44.81 
 
 
262 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  44.86 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  43.62 
 
 
257 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  42.8 
 
 
283 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  42.8 
 
 
252 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  42.8 
 
 
252 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  43.03 
 
 
244 aa  214  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  42.32 
 
 
292 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  43.21 
 
 
242 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  41.56 
 
 
242 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.92 
 
 
242 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  41.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  41.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  41.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  41.08 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  40.66 
 
 
256 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  44.03 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  39.43 
 
 
249 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  37.45 
 
 
246 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 
243 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  31.93 
 
 
243 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  31.54 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  29.83 
 
 
243 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  30.25 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  30.25 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  29.83 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  29.83 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  29.83 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  30.25 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  29.83 
 
 
243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
237 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.86 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.51 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.6 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.6 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  28.05 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.73 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.39 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.05 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.94 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.83 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  29.83 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.57 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27.09 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  29.28 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  29.28 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  25.38 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.32 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.42 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  25.97 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.36 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  33.85 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  33.62 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.83 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.1 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>