More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1679 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  100 
 
 		 243 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  50.83 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  51.24 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  50.42 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  50.62 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  41.42 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  42.68 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 		 269 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  46.41 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  44.4 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  41.42 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.91 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  41.42 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  44.54 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  42.32 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  38.17 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  38.17 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  38.17 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  38.17 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  41.49 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  37.76 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  37.76 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.76 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  37.76 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  37.76 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  37.76 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  37.34 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  34.3 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  32.37 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  32.37 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  31.95 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  31.95 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  31.95 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  31.95 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  31.95 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  31.54 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  31.54 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  30.89 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.02 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.95 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.32 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.37 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.37 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.95 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  24.23 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.57 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.17 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.45 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.17 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.55 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.47 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.48 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.7 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.26 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  32.32 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.65 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0029  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.67 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.73 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  35.11 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>