More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1254 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  54.5 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  58.37 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  53.18 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  51.57 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  52 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  51.58 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  53.49 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  55.35 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  46.22 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.93 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  27.37 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  27.37 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.37 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  33.93 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.82 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  26.82 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  26.82 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.49 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.82 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.16 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.57 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  22.27 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  22.95 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.9 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  22.95 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  21.05 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.27 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  21.05 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  32.77 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.23 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  21.05 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  21.03 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.23 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  20.41 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  22.95 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.23 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  21.86 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  33.6 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  21.11 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.62 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  22.4 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.61 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.7 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.2 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.28 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.04 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.82 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>