More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0039 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  69.21 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  68.77 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  66.23 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  68.11 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  53.95 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.15 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  42.71 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  41.02 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  40.27 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.42 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  37.76 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  37.24 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.33 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  34.97 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 326 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.21 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.69 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  32.55 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 206 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 355 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.25 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 212 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.51 
 
 		 206 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.12 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.23 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.29 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.39 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.31 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.05 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.37 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.58 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  38.05 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.09 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.67 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  28.83 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.17 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 115 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.98 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.94 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>