More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0356 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  44.04 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.48 
 
 		 312 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.89 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  41.39 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  39.07 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  39.4 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.65 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  34.3 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  35.69 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.22 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 341 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  30.36 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.04 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  30.56 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 349 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  28.82 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  31.69 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.5 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 331 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  31.12 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  29.6 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  30.55 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 328 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.53 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.16 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.58 
 
 		 207 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  30.41 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.41 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  39.31 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.84 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  40.4 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.57 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.2 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.6 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1338  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.42 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 117 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0272  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.29 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4270  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0859626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>