More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2400 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  100 
 
 		 330 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  52.46 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  53.09 
 
 		 349 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  49.85 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  51.27 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  50.32 
 
 		 340 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  49.11 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  46.75 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  53.75 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  45.81 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.6 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.7 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.08 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.41 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  35.67 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  36.55 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  34.6 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  31.61 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  30.42 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.82 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  30.16 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.11 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.77 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.11 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.55 
 
 		 207 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 206 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  26.79 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.65 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.65 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  39.42 
 
 		 629 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.65 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.39 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 115 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.72 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.42 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.91 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.91 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.92 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  34.31 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 125 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 119 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  45.35 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  37.96 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>