More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1556 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  256  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  64.66 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  58.77 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  60.19 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  63.54 
 
 		 183 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  57.02 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  58.97 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.7 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  58.65 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.86 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  56.88 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  59.8 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  68.35 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  68.35 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  69.14 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  53.04 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  52.54 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  57.45 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  55.14 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  53.27 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  59.34 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  50.43 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  54.17 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  54.67 
 
 		 336 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  56.79 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 		 349 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  59.76 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 		 347 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 337 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 		 337 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 124 aa  96.7  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  51.65 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  43.64 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.63 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  39.25 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  39.25 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  50.63 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  46.38 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  46.38 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  50.72 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.73 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.18 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  49.37 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  40.74 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  48.1 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  43.21 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  43.21 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  48.1 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  48.15 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>