More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0126 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
125 aa  247  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  96.8 
 
 
125 aa  241  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  83.19 
 
 
120 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  68.1 
 
 
124 aa  166  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  60.91 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  55.75 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  63.46 
 
 
127 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  63.33 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  71.08 
 
 
129 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 
131 aa  121  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  64.21 
 
 
125 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  60.82 
 
 
116 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  65.85 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  62 
 
 
124 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  54.64 
 
 
118 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 
127 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
127 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 
124 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  50 
 
 
123 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 
121 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
123 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  59.14 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  56.99 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  59.76 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
125 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  47.27 
 
 
336 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  64.63 
 
 
108 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 
116 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
123 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 
113 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  55.32 
 
 
119 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
126 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  58.23 
 
 
120 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
120 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  56.32 
 
 
109 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  52 
 
 
126 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
125 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
125 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
125 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  55.7 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  52.17 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
337 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 
347 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
349 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  57.33 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  66.18 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
337 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.57 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
341 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.12 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
327 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  50 
 
 
341 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  48.86 
 
 
120 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
317 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  49.41 
 
 
349 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
354 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  49.41 
 
 
342 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  53.62 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.05 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.82 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40.54 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.36 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.67 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  54.39 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>