More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  100 
 
 		 336 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  72.59 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  70.18 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  76.23 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  74.33 
 
 		 334 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  69.88 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  76.56 
 
 		 329 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  70.57 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  71.08 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 335 aa  302  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  46.88 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  37.41 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.11 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  33.22 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.2 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.54 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.54 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  32.06 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  29.5 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  34.22 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  33.1 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  31.53 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.27 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.77 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  28 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.7 
 
 		 207 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.7 
 
 		 207 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  30.74 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.96 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.38 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  46.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  46.97 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 120 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  40.74 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 991 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.93 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.75 
 
 		 93 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  35.15 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.46 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 		 109 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>