More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1784 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 114 aa  235  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  55.34 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  53.68 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  53.68 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  59.3 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  58.97 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  58.97 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  54.17 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  45.45 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.59 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.48 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  55.71 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 337 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  44.3 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.62 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  52.56 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  42.47 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  44.16 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  46.27 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  47.76 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>