More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1749 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  40.49 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  40.76 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.47 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.54 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  37.26 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  43.17 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  47.71 
 
 		 121 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  28.1 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  31.58 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.38 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08910  polyketide synthase, putative (JCVI)  27.96 
 
 		 2449 aa  62.4  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.65 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  24.48 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.98 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  24.86 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.19 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.19 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.19 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.19 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.19 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  33.85 
 
 		 2534 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  35.92 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  25.76 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.45 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.73 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08412  hybrid PKS-NRPS (Eurofung)  32.52 
 
 		 3930 aa  58.2  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  32.29 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  27.52 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  37.84 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  33.9 
 
 		 1140 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.09 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.08 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.09 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.32 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.55 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.09 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.69 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.09 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  28 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>