More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0236 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
120 aa  244  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  65.77 
 
 
121 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  61.86 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  62.81 
 
 
124 aa  160  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  62.81 
 
 
124 aa  159  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  61.06 
 
 
125 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  62.81 
 
 
124 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  63.72 
 
 
125 aa  154  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  57.76 
 
 
119 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  56.9 
 
 
119 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  56.3 
 
 
122 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  54.7 
 
 
125 aa  141  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  54.7 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  52.46 
 
 
125 aa  140  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  53.72 
 
 
125 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
125 aa  139  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
125 aa  139  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  54.31 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  52.68 
 
 
121 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  60.64 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 
123 aa  123  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  47.01 
 
 
122 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  45.22 
 
 
122 aa  123  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 
119 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 
120 aa  120  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
122 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  49.55 
 
 
120 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
125 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  45.61 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  46.85 
 
 
119 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  59.78 
 
 
100 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  48.65 
 
 
120 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  50.43 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  52.58 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
173 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  58.14 
 
 
111 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
123 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
125 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  56.18 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
139 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
124 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
106 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
117 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 
126 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  39.32 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  41.8 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
115 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  42.27 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  38.61 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  37.86 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  42.7 
 
 
98 aa  84  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
133 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  38.32 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  34.82 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  42.68 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0116  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.92 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2281  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3096  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1075  regulatory protein, ArsR  40.79 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3238  Fis family transcriptional regulator  35.64 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>