More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0756 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  59.91 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 
221 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  56.36 
 
 
220 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
221 aa  244  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  54.59 
 
 
253 aa  234  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
226 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
222 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
228 aa  201  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 
222 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  47.87 
 
 
218 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
218 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  43.13 
 
 
234 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  41.59 
 
 
223 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  44.65 
 
 
221 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  45.75 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
218 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
227 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  45.33 
 
 
223 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
233 aa  168  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
226 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
218 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  39.6 
 
 
219 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
227 aa  158  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  157  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
227 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
230 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.67 
 
 
221 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
231 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
224 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
232 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  40.85 
 
 
221 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 
221 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  38.97 
 
 
221 aa  138  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  35.2 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  48.57 
 
 
124 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
124 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 
114 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  52.94 
 
 
128 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.53 
 
 
170 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  43.43 
 
 
336 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
167 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
110 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
129 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 
150 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  28.95 
 
 
119 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.45 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
123 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
480 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.66 
 
 
118 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  42.05 
 
 
98 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
150 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  33.65 
 
 
117 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  39.77 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40.95 
 
 
201 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.03 
 
 
135 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
470 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
142 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.2 
 
 
118 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  31.76 
 
 
165 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
110 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 
125 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  31.97 
 
 
138 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 
149 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  32.99 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
144 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
136 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
101 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
137 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.67 
 
 
135 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
480 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
106 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
129 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
136 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
142 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
119 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
111 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  45.31 
 
 
132 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
115 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 
98 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 
109 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>