More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3240 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  95.02 
 
 		 221 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  86.36 
 
 		 221 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 223 aa  214  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  48.83 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  47.44 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  45.75 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  46.82 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  45.75 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  41.78 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  42.54 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  39 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  65.14 
 
 		 124 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 124 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  52.21 
 
 		 114 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  39.05 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 138 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.6 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  44 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.33 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  41.03 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 105 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  36.46 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.42 
 
 		 118 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  44.21 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.16 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  25.84 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  41.43 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  36.96 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 120 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 98 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>