More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0912 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  38.92 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  37.16 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40.1 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.18 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.5 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.68 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  37.06 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 189 aa  121  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  33.73 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 124 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 124 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 114 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  41.74 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  41.56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  32.98 
 
 		 102 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 108 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 102 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.04 
 
 		 938 aa  56.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 470 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  37.23 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 110 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 466 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 120 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 117 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 129 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 102 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  35.45 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 		 114 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 114 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 568 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  38.27 
 
 		 423 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  40.58 
 
 		 113 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  38.57 
 
 		 353 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 111 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 111 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 463 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 127 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.81 
 
 		 813 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 129 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>