More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20100 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  100 
 
 
113 aa  229  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 
119 aa  96.7  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
110 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  47.47 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  42.16 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.89 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  34.91 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.46 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  45.68 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
317 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  53.97 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  37.97 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6743  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.661837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.08 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  44.93 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
323 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
337 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  40.54 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  52.46 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.02 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.25 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  52.46 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  52.46 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.02 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  52.46 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.89 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.89 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
342 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>