More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4852 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
114 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  70.75 
 
 
120 aa  161  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  64.81 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  67.33 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  61.17 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  57.41 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
135 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 
135 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  54.81 
 
 
137 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  53.92 
 
 
114 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  48.35 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  41.84 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  35.45 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.86 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.86 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
348 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
312 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
307 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
307 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
305 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.08 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 
98 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  40.62 
 
 
306 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
339 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
317 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>