More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3560 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 109 aa  214  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  70.87 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  60.19 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.4 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  51.92 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  49.04 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  51.69 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  43.69 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.35 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.24 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  27.08 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40.79 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  30.93 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  31 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  42.67 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  45.33 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  31.31 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  36.08 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  40 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>