More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1120 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
125 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  79.03 
 
 
125 aa  197  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  73.6 
 
 
123 aa  180  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  65.55 
 
 
122 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  65.55 
 
 
122 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  65.55 
 
 
122 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  63.96 
 
 
125 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  51.28 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
115 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  53.68 
 
 
129 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  47.27 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  46.23 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  42.45 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  35.09 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
106 aa  66.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.43 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  35.79 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.66 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
221 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  31.58 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  31.9 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
220 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  34.55 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 
102 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  29 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  36.89 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  31.65 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>