More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1936 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  59.77 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  50.62 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  48.78 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  46.34 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  50.65 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  50.65 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  43.75 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  53.62 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  47.06 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
115 aa  76.6  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  46.75 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  42.65 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  46.97 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  37.5 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  45.95 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.16 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  44 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  44 
 
 
124 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  42.31 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.65 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.65 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  45.07 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  45.33 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>