More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0872 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  223  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  69.91 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  66.37 
 
 		 114 aa  146  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  71.3 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  70.09 
 
 		 115 aa  143  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  65.42 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  66.97 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  66.98 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  60.38 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.48 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  54.81 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  60.23 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  96.7  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.99 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  50.47 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.59 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.59 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  44.14 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  46.67 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.78 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.36 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  31.03 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.07 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.07 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  39.33 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29.29 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  43.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  29.7 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  38.27 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>