More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3721 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  229  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  70.37 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  62.64 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  61.18 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  52.5 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  55.13 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  52.56 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  41.94 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.71 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  42.17 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 93 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 218 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.08 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  35.06 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  33.33 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  47.44 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>