More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3028 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  243  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  63.96 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  63.48 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  63.06 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  59.8 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  56.7 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  96.7  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  51.55 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  44.86 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  42.73 
 
 		 113 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  33.94 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  33.94 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  31.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.98 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  27.96 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  27.96 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.02 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  38 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40.38 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  32.14 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  39.74 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>