More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 122 aa  236  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  65.69 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  51.28 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  52.68 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  47.9 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  51.58 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.18 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  48.94 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  45.05 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  45.1 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.46 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.06 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  44.58 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  40.79 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.74 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  49.38 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  39.51 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  29.33 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  29.33 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  41.56 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>