More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1709 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
134 aa  274  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  47.93 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
100 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  48.81 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  48.81 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 
111 aa  87.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 
105 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 
108 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  45.83 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40.51 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.46 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  36.84 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.62 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.9 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  35.29 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  48.05 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  45.95 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.37 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  32.56 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  37.14 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.96 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.96 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2308  ArsR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.67 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.06 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  37.78 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  37.61 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>