More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3748 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  32.29 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.56 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.31 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.35 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40.74 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40.74 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  40.79 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.79 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  40 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  40.3 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35.24 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  33.71 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  32.73 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>