More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4227 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  68.47 
 
 		 113 aa  156  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  70.64 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  70.09 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  70.09 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  66.06 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  52.34 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  54.08 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.98 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  43.52 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  48.51 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  55.68 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.25 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.25 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  47.52 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  37.76 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  29.89 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  29.11 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  29.79 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  29.11 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  45.95 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  34.94 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.03 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  36.67 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  29.21 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  34.44 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>