More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1191 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
105 aa  221  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  54.35 
 
 
104 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  52.81 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  52.13 
 
 
94 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  51.06 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  51.06 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  50.72 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
95 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  49.28 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  50 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  40.26 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.78 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  35.63 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  40.3 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  34.25 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  39.76 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  38.16 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  32.26 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  38.16 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  38.71 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>