More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  85 
 
 		 121 aa  208  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  54.62 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  49.59 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  51.35 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  56.12 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  55.79 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  61.73 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  49.54 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  57.69 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  52.75 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  55.42 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  44.34 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  42.16 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  46.99 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.14 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  46.34 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  45.68 
 
 		 347 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 337 aa  80.1  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  42.17 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 337 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  36.97 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  33.93 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  38.55 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  38.36 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  37.84 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  35.37 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.91 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40.91 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.5 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40.91 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>