More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0367 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 337 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  58.92 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  60.06 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  61.28 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  57.82 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.61 
 
 		 219 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  44.86 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  43.93 
 
 		 222 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  47.52 
 
 		 215 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 217 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 217 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 217 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  44.39 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  43.5 
 
 		 225 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.76 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.14 
 
 		 227 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.94 
 
 		 136 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  56.92 
 
 		 136 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  54.62 
 
 		 136 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 		 137 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.54 
 
 		 138 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.91 
 
 		 139 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.19 
 
 		 229 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.84 
 
 		 139 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.76 
 
 		 139 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 		 140 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  48.91 
 
 		 147 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.49 
 
 		 136 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  52.34 
 
 		 135 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.56 
 
 		 135 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.52 
 
 		 141 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  51.45 
 
 		 148 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.91 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.97 
 
 		 453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.56 
 
 		 143 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.35 
 
 		 150 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  48.85 
 
 		 136 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  49.22 
 
 		 498 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.44 
 
 		 135 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.15 
 
 		 147 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 		 150 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 144 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.21 
 
 		 130 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  49.22 
 
 		 157 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  47.24 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.15 
 
 		 138 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 		 174 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 125 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 125 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 125 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 125 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  43.93 
 
 		 116 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 125 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 113 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 		 118 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.44 
 
 		 115 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  45.3 
 
 		 129 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 112 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 		 120 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  44.66 
 
 		 120 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.64 
 
 		 105 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 131 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 116 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 123 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 104 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 126 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 		 142 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  42.65 
 
 		 138 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 		 119 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 		 151 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 148 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  52.56 
 
 		 123 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 127 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  53.16 
 
 		 183 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 127 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 120 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  39.26 
 
 		 151 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 127 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  51.28 
 
 		 127 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 120 aa  89.7  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  44.83 
 
 		 126 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  48.31 
 
 		 127 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 		 137 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 125 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 132 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 124 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  48.24 
 
 		 125 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 136 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  59.09 
 
 		 122 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  38.35 
 
 		 147 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 		 137 aa  87  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 		 132 aa  87  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 123 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.37 
 
 		 408 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  51.39 
 
 		 124 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 		 137 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 		 137 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>