More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1009 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 174 aa  350  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  59.54 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  57.78 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  59.54 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.83 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.96 
 
 		 135 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  52.59 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  62.71 
 
 		 138 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  54.96 
 
 		 136 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  54.26 
 
 		 147 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.14 
 
 		 138 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.59 
 
 		 143 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.24 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.91 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.26 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.49 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  54.2 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.35 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.03 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.33 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.54 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.54 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.27 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.81 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  51.15 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  49.24 
 
 		 225 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  50.37 
 
 		 498 aa  127  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  52 
 
 		 144 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.33 
 
 		 453 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  52.76 
 
 		 347 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 		 225 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  49.61 
 
 		 337 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  48.06 
 
 		 223 aa  121  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  48.06 
 
 		 294 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  46.46 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48 
 
 		 130 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.57 
 
 		 229 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  47.11 
 
 		 336 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  45.67 
 
 		 337 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.52 
 
 		 147 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.01 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.94 
 
 		 408 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.19 
 
 		 141 aa  87.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  38.57 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.39 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  39.26 
 
 		 151 aa  85.9  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  37.59 
 
 		 255 aa  84.7  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 		 140 aa  84  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0958  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  36.59 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0969  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.420605  normal  0.145291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  37.68 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.62 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  38.52 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.42 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  34.68 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.1 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  35.38 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  37.21 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  34.68 
 
 		 132 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  36.59 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  37.3 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  34.62 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  36.23 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 		 137 aa  72  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 135 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  32.8 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>