More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0566 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
136 aa  276  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  86.57 
 
 
148 aa  238  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  82.09 
 
 
135 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  80.6 
 
 
135 aa  228  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  75.37 
 
 
453 aa  222  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  73.88 
 
 
140 aa  218  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.1 
 
 
138 aa  216  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  79.69 
 
 
147 aa  215  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  77.34 
 
 
150 aa  214  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75.38 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  73.88 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  75 
 
 
139 aa  209  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.39 
 
 
135 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  74.05 
 
 
139 aa  207  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.93 
 
 
141 aa  204  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.66 
 
 
143 aa  197  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  67.65 
 
 
215 aa  197  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  73.28 
 
 
498 aa  196  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  70.31 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.09 
 
 
136 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  67.94 
 
 
136 aa  190  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  67.42 
 
 
136 aa  188  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.41 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  65.65 
 
 
136 aa  185  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  67.97 
 
 
223 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  70 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  66.41 
 
 
222 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  64.84 
 
 
294 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  66.41 
 
 
217 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  66.41 
 
 
217 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  66.41 
 
 
217 aa  177  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  64.84 
 
 
225 aa  176  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  64.06 
 
 
225 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.78 
 
 
408 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  60.16 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  62.99 
 
 
227 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.63 
 
 
227 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  54.76 
 
 
144 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.91 
 
 
219 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
337 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.3 
 
 
347 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.59 
 
 
130 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  54.96 
 
 
174 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.91 
 
 
229 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  50.78 
 
 
135 aa  126  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  48.85 
 
 
337 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  55.47 
 
 
349 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.19 
 
 
147 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 
147 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  48.8 
 
 
137 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  50.41 
 
 
336 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  46.92 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 
132 aa  117  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
133 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.78 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.27 
 
 
145 aa  106  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.61 
 
 
151 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
137 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.44 
 
 
143 aa  103  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 
138 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  42.54 
 
 
146 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.53 
 
 
131 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.19 
 
 
130 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  42.11 
 
 
138 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 
137 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  44.19 
 
 
130 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 
131 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
133 aa  100  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0834  arsenate reductase ArsC  39.37 
 
 
132 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0765762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0827  arsenate reductase ArsC  39.37 
 
 
132 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.848042  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  41.09 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  37.21 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.39 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  39.53 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.71 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  38.52 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
135 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 
132 aa  94  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.84 
 
 
140 aa  93.2  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  40.71 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  45.31 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  38.93 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  38.93 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  39.69 
 
 
134 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.56 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  33.6 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2155  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  33.6 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
142 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  37.23 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>